Biyoinformatik temel kavramlar: hizalama ve BLAST

Biyoinformatik Temel Kavramlar

Biyoinformatik, biyolojik verilerin analizinde bilgisayar bilimi, istatistik ve matematik kullanır. İki önemli kavram hizalama ve BLAST\'dır.

Hizalama

Hizalama, iki veya daha fazla biyolojik dizinin benzerliğini değerlendirmeye yönelik bir tekniktir. İki temel türü vardır:

• Global Hizalama: Tüm dizilerin tamamen hizalanmasını sağlar. Genellikle benzer uzunluktaki diziler için kullanılır.
• Local Hizalama: Dizilerin belirli bölümlerini hizalar. Genellikle farklı uzunlukta ve yapıda diziler için uygundur.

Hizalama, genetik eşleşmeleri veya protein fonksiyonlarını anlamada kritik öneme sahiptir.

BLAST

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), biyoinformatikte en fazla kullanılan hizalama aracı olan bir algoritmadır. Temel özellikleri şunlardır:

• Verimlilik: Büyük veri setleri üzerinde hızlı hizalamalar yapar.
• Hassasiyet: Benzer dizileri bulma yeteneği ile genetik araştırmalarda yüksek doğruluk sağlar.
• Kullanım Kolaylığı: Kullanıcı dostu arayüzler ile geniş bir kullanıcı kitlesine hitap eder.

BLAST, genellikle gen dizileri veya protein dizileri üzerinde yapılan karşılaştırmalarda kullanılır.