Omik verilerinin görselleştirilmesi: Manhattan ve volcano plot

Omik Verilerinin Görselleştirilmesi

Omik verilerinin analizinde, görselleştirme teknikleri önemli bir rol oynar. İki popüler görselleştirme yöntemi, Manhattan ve volcano plotlardır.

Manhattan Plot

Manhattan plot, genellikle genetik çalışmalarda kullanılır. Belirli bir kromozom üzerindeki genlerin veya SNP\'lerin (Tek Nükleotid Polimorfizm) p-değerlerini gösterir.

• X ekseni: Genom üzerindeki konumlar
• Y ekseni: -log10(p-değeri)
• Yüksek noktalar: İstatistiksel olarak anlamlı genler

Volcano Plot

Volcano plot, genellikle gen ekspresyonu analizlerinde kullanılır. İki farklı koşul arasındaki değişiklikleri gösterir.

• X ekseni: Log2(deşifre edilen ifade değişimi)
• Y ekseni: -log10(p-değeri)
• Yüksek noktalar: İstatistiksel olarak anlamlı değişiklikler

Bu iki yöntem, araştırmacılara verilerini görsel olarak anlamlandırma ve yorumlama imkanı sunar.